Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CYSRT1A8MQ03 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYSRT1A8MQ03 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms