Protein–RNA interactions for Protein: A6NKX1

FAM223B, Protein FAM223B, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM223BA6NKX1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM223BA6NKX1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM223BA6NKX1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms