Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACOD1A6NK06 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms