Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC69A6NI79 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC69A6NI79 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms