Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP73A6NFT4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP73A6NFT4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms