Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP17L4A6NCW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms