Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FARSAQ9Y285 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FARSAQ9Y285 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms