Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TNFSF18Q9UNG2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms