Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PNMA8BQ9ULN7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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