Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FBXO4Q9UKT5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms