Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GJD2Q9UKL4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms