Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CASP8AP2Q9UKL3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP8AP2Q9UKL3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms