Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHIC2Q9UKJ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms