Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms