Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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