Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CHRNA9Q9UGM1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA9Q9UGM1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms