Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IFT172Q9UG01 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT172Q9UG01 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms