Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS29Q9UBQ0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPS29Q9UBQ0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms