Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL13Q9P2N7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL13Q9P2N7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms