Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCHIP1Q9P0W5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms