Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TOR4AQ9NXH8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms