Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SDHAF2Q9NX18 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SDHAF2Q9NX18 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms