Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GJB4Q9NTQ9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GJB4Q9NTQ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms