Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC4BQ9NT99 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms