Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTNNBIP1Q9NSA3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms