Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HELLSQ9NRZ9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HELLSQ9NRZ9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms