Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TULP4Q9NRJ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TULP4Q9NRJ4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms