Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C8orf4Q9NR00 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms