Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms