Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHD4Q9H223 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms