Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP44Q9H0E7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
USP44Q9H0E7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms