Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP1Q9GZU7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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