Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCSER1Q9C0I3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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