Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LNPKQ9C0E8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms