Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CIPCQ9C0C6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CIPCQ9C0C6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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