Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ROPN1BQ9BZX4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms