Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PCGF6Q9BYE7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms