Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PACSIN1Q9BY11 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PACSIN1Q9BY11 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms