Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PBDC1Q9BVG4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms