Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HINFPQ9BQA5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms