Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD9AQ99638 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms