Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPS6KC1Q96S38 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms