Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TGS1Q96RS0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TGS1Q96RS0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms