Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRERF1Q96PN7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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TRERF1Q96PN7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRERF1Q96PN7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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