Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms