Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TSNARE1Q96NA8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TSNARE1Q96NA8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms