Protein–RNA interactions for Protein: Q96LJ8

UBXN10, UBX domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN10Q96LJ8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UBXN10Q96LJ8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBXN10Q96LJ8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms