Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COG3Q96JB2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG3Q96JB2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms