Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CPNE2Q96FN4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms