Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EFHD2Q96C19 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EFHD2Q96C19 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms